宝藏之谜！无人岛大冒险！小智一行来到椰子岛，他们听三色堇说附近的无人岛埋藏着一个与神奇宝贝有关的传说宝藏。神奇宝贝记者三色堇曾经去过一间海盗博物馆取材，并在调查后发现了宝藏的地图和暗号。火箭队偷听到小智他们的对话后决定抢先一步，到无人岛抢走宝藏。小智他们来到无人岛后不断受到不同的神奇宝贝袭击，而这些申请表都有一个共通点…究竟他们最后能否成功发现宝藏！？
