枪的世界回到现实世界快要满一年，桐人也逐渐适应现实。这天，他和亚丝娜约在东京的皇居见面，两人谈论著现实与虚拟世界的不同。而在那同时，热门拟真线上游戏“GunGaleOnline”中，却发生了有人在游戏里受到枪击，在现实中也同时心脏衰竭的奇特案件，并且类似的案件有二件。政府"假想课"的课员菊冈调二郎找上了桐人，希望他能潜入“GunGaleOnline”与凶手接触…。
