南京先锋书店于1996年在南京创立，是国内知名的民营学术书店，自创立以来探索出一条以"学术、文化沙龙、咖啡、艺术画廊、电影、音乐、创意、生活、时尚"为主题的文化创意品牌书店经营模式，搭建一座可供开放、探讨、分享的公共性平台。其为读者打造的建筑之元素、宗教之情结、人文之关怀的书店阅读空间，吸引了众多国内外读者的聚集，使其成为南京重要的文化地标。先锋书店是南京的著名文化名片，也是江苏最大的人文社科专业书店，是南京人民集体意志创造的结晶，它铸造的不仅是先锋风格的人文品牌，更是南京人民的精神品格和思想品质。南京先锋书店被南京市民评为十二张文化名片之一，被誉为"中国最美的书店"，荣获"中国2009年度最美的书店奖"，附近南京大学的学生亲切地称她为"南大第二图书馆"。2013年，CNN专题报道先锋书店，赞称"中国最美书店"。2014年3月，被英国广播公司BBC评为全球十大最美书店。2015年6月，被英国卫报评为"全球十二家最美书店"。2015年8月，美国有线电视新闻网(CNN)选出17家"全球最酷书店"，先锋书店名列其中。2016年3月，美国《国家地理》评选出全球十大书店，南京先锋书店入选，系亚洲唯一入选书店。截至2017年5月，先锋书店五台山店为总店，地下车库改造而成的总店风景独特，其内独辟二手书店区，创意产品展售馆，先锋艺术咖啡馆，沙龙活动专区，另有十二家分店遍布江浙皖三省。
先锋书店(南宁)目前已在宾阳县有网点。